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第三部分：《经》上下、《经说》上下、《大取》、《小取》六篇，都是后来庄子的别墨。
第四部分：《耕柱》、《贵义》、《公孟》、《鲁问》、《公输》五篇，是墨子一生的言行集，相当於儒家的《论语》。
第五部分：自《备城门》以下到《杂守》，凡十一篇，所记都是墨家守城备敌的方法。
墨家的基本思想主要有以下十点：
1、兼爱：无差别的博爱、去亲疏与社会阶级分别。（与儒家的小康社会或中庸中亲亲为大相反，而与大同中的不独亲其亲，不独子其子相似，将父慈、子孝、兄友、弟悌…等等的亲人对待方式，扩展到其他陌生人身上。）
2、非攻：反对侵略战争。（战争对於败者的伤害及，伤人命、损其才，是没有意义的破坏行动。而对於胜方而言，仅仅是获得了数座城池与税收，但总的来说伤害与损失也是巨大的，所以战争是没有意义的行为。）
3、尚贤：不分贵贱唯才是举。
4、尚同：上下一心为民服务，为社会兴利除弊。（有一说法为上同，认为天子是百官之首，而百姓听令百官，与上而同，此乃上同之意。）
5、天志：掌握自然规律。（有一说法为天子代天行政，并藉由上同的观念推论出人民以天的意志而行事。）
6、明鬼：尊重前人智慧和经验。（有一说法认为墨家说鬼所为并非迷信，而是希望以神鬼之说使人民警惕，不行邪恶。）
7、非命：通过努力奋斗掌握自己的命运。
8、非乐：摆脱划分等级的礼乐束缚，废除繁琐奢靡的编钟制造和演奏。（古代音乐费时耗事，花费甚大，於国家并无生产的行为，乃无用之事。）
9、节用：节约以扩大生产。反对奢侈享乐生活。
10、节葬：不把社会财富浪费在死人身上。（反对儒家的厚葬耗钱财，守丧则需三年，三年过后人虚弱需要人扶才能起行，影响国家生产力，乃浪费之事。）
墨家逻辑是墨家学派中的一种逻辑，主要以三物论为代表，三物分别为故、理、类。墨辩是讲解墨家逻辑的主要着作。
近代有大量学者钻研《墨经》，发现《墨经》几乎涵盖了哲学、逻辑学、心理学、政治学、伦理学、教育学、自然科学等多个学科内容。
胡适说：墨家论知识，注重经验，注重推论，看《墨辩》中论光学和力学的诸条，可见墨学者真能做许多实地实验。这正是科学的精神，是墨学的贡献。
墨家把推理称为说，《经上》曰：说，所以明也；《经下》云：在诸其所然未然者，说在於是推之。
《小取》中还提到或、假、效、辟、侔、援、推七种推理形式。墨子常批评儒者答非所问，墨子问儒者，何以为乐，答曰：乐以为乐也。墨子批评道：今我问曰：何故为室？曰：冬避寒焉，夏避暑焉，室以为男女之别也。则子告我为室之故矣。今我问曰：何故为乐？曰：乐以为乐也。是犹曰：何故为室？曰：室以为室也。。
墨子还是一个杰出的科学家，在力学、几何学、代数学、光学等方面，都有重大贡献，是当代诸子所望尘莫及。
《墨经》中提出了端、尺、区、穴等概念，大致相当於近代几何学上的点、线、面、体。墨家在科学上的成就为众多学者所称赞，李约瑟指出：墨家思想所遵循的路线如果继续发展下去，可能已经产生欧几里得几何体系了。
蔡元培认为：先秦唯墨子颇治科学。
《淮南子要略》载：墨子学儒者之业，受孔子之术。
《汉书艺文志诸子略》中说：墨家者流，盖出於清庙之守。茅屋采椽，是以贵俭；养三老五更，是以兼爱；选士大射，是以上贤；宗祀严父，是以右鬼；顺四时而行，是以非命；以孝视天下，是以上同；此其所长也。及蔽者为之，见俭之利，因以非礼，推兼爱之意，而不知别亲疏。。
汪中《述学墨子序》：其在九流之中，惟儒足与之相抗，自余诸子，皆非其比。
翁方纲《复初斋文集》卷十五《书墨子》攻击道:有生员汪中者，则公然为《墨子》撰序，自言能治《墨子》，且敢言孟子之言兼爱无父，此则又名教之罪人，又无疑也。